يتمثل دور وزارة الدولة لشؤون المجلس الوطني الاتحادي في نطاق مرحلة التنسيق بين الحكومة والمجلس الوطني الاتحادي، في الآتي:
- استلام طلب المجلس الوطني الاتحادي بمناقشة موضوع عام متعلق بشؤون الإتحاد يدخل ضمن اختصاصاته، وذلك بناءاً على طلب مقدم من خمسة من أعضائه على الأقل.
- مخاطبة وزارة شؤون مجلس الوزراء لعرض الموضوع المطلوب مناقشته على مجلس الوزراء ليقرر ما يراه مناسباً بشأنه.
- يعقب صدور قرار مجلس الوزراء بشأن طلب المجلس الوطني مناقشة الموضوع العام قيام وزارة شؤون مجلس الوزراء بإبلاغ وزارة الدولة لشؤون المجلس الوطني الاتحادي بقرار مجلس الوزراء سواء بالموافقة أو الرفض.
- تقوم الوزارة بإبلاغ المجلس الوطني الاتحادي بموافقة مجلس الوزراء على مناقشة الموضوع العام وفقاً للمحاور المحددة في طلب المناقشة. أما إذا كان قرار مجلس الوزراء بالرفض، تقوم الوزارة بإبلاغ المجلس الوطني الاتحادي برفض مجلس الوزراء مناقشة الموضوع العام إذا رأى أنه يتعارض مع المصالح العليا للاتحاد.
- تنسيق حضور الوزير المختص جلسة مناقشة الموضوع العام.
- تقوم وزارة الدولة لشؤون المجلس الوطني الاتحادي -بعد إنتهاء المجلس الوطني الاتحادي من مناقشة الموضوع العام- بعرض التوصيات التي يصدرها المجلس الوطني الاتحادي بشان الموضوع العام على مجلس الوزراء الموقر لإبداء رأيه فيها.